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  • 【Python】 파이썬 주요 트러블슈팅 [81-100] 파이썬 주요 트러블슈팅 [81-100] 추천글 : 【Python】  파이썬 목차  81. AnnDataReadError: Above error raised while reading key '/layers' of type from /.⑴ (package) 문제 상황 : scanpy.read_h5ad를 실행할 때 문제가 발생함⑵ (package) 해결 방법 : anndata 버전을 0.7.8에서 0.9.2로 향상 (ref)  82. KeyError: 'y'⑴ (grammar) 문제 상황 : sc.pl.violin(adata, keys=celltype, groupby='annotation')을 할 때 문제가 발생 ⑵ (grammar) 원인 : adata.obs[celltype]가 NaN 값을 포함하는 경우 .. 공감수 3 댓글수 6 2024. 6. 7.
  • 【Python】 파이썬에서 R 실행하기 파이썬에서 R 실행하기 (rpy2 이용) 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. 개요 [본문]a. R에서 파이썬 실행하기 1. 개요 [목차]⑴ 파이썬에서 xCell 실행하기  import scanpy as scimport pandas as pdimport rpy2.robjects as rofrom rpy2.robjects import pandas2rifrom rpy2.robjects.conversion import localconverteradata = sc.read_visium('./GSE206552_RAW/GSM6256810_meta1')dat = adata.X.toarray().Tdat = pd.DataFrame(dat, index=adata.var.index, columns=adata.obs.. 공감수 1 댓글수 2 2024. 4. 30.
  • 【Python】 자연어 처리 및 LLM 유용 함수 모음 자연어 처리 및 LLM 유용 함수 모음  추천글 : 【Python】 파이썬 유용 함수 모음, 【알고리즘】 21강. NLP와 LLM 1. 자연어 처리 유용 함수 [본문]2. Llama2 응용 [본문]a. ollama.ai : Llama3, Phi-3, Mistral, Gemma, etcb. GroqChat : Mixtral, Llama3, Gemma 1. 자연어 처리 유용 함수 [목차]⑴ 주어진 문장을 자동으로 영어로 번역하는 함수 ! pip install --upgrade googletrans httpx httpcore deep_translatordef to_english (sentence): from deep_translator import GoogleTranslator translated .. 공감수 4 댓글수 0 2024. 2. 10.
  • 【Python】 파이썬 앱 라이브러리 파이썬 앱 라이브러리(Python app library) 추천글 : 【컴퓨터과학】 컴퓨터과학 목차, 【Python】 파이썬 목차 1. 정사면체의 3차원 뷰어 [본문]2. 파이썬 시각화를 위한 Bokeh 설치하기 [본문]3. 파이썬으로 html 형식의 글을 자동 생성하는 것 (automatic PDF report) [본문]4. 메타 Segment-Anything Model (SAM) + 공간전사체 분석 (IAMSAM) [본문]5. 유기화합물 3차원 분자식 [본문]📃 파이썬 프로젝트 만들기: app.py ▶ 파이썬 코드를 이용한 앱 제작 과정 🖥️ html 앱 라이브러리  1. 정사면체의 3차원 뷰어 [목차] import dashfrom dash import html, dccfrom dash.depend.. 공감수 2 댓글수 0 2023. 11. 15.
  • 【Python】 MinIO 유용 함수 모음 MinIO 유용 함수 모음 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. MinIO [본문]2. 파이썬 유용 함수 모음 [본문] 3. 터미널 유용 커멘드 모음 [본문]  1. MinIO [목차]⑴ AWS S3-compatible object storage system⑵ Synology NAS의 상위 버전 ① 이유 1. 한 번 업로드 하면 삭제가 불가능하도록 셋팅할 수 있음 ② 이유 2. 보안 수준이 더 높음⑶ 사용법 ① 1단계. 여기에서 MinIO Client 설치 : Linux Intel인 경우 다음과 같음 curl https://dl.min.io/client/mc/release/linux-amd64/mc \ --create-dirs \ -o $HOME/minio-binaries/mcchmod +x .. 공감수 1 댓글수 0 2023. 8. 20.
  • 【Python】 파이썬 주요 트러블슈팅 [61-80] 파이썬 주요 트러블슈팅 [61-80] 추천글 : 【Python】  파이썬 목차  61. ImportError: libGL.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory⑴ (package) 문제 상황 : import cv2를 할 때 문제가 발생함 ⑵ (package) 해결방법 1. Ubuntu/Debian sudo apt-get updatesudo apt-get install -y libgl1-mesa-glxpip uninstall opencv-pythonpip install opencv-python ⑶ (package) 해결방법 2. CentOS/Fedora sudo yum updatesudo yum install -y mesa-libG.. 공감수 1 댓글수 0 2023. 8. 17.
  • 【Python】 파이썬 프로젝트 만들기: app.py 파이썬 프로젝트 만들기: app.py 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. 프로젝트 구성 [본문] 2. 프로젝트 실행 [본문] a. 파이썬 앱 라이브러리 1. 프로젝트 구성 (예시) [목차] ⑴ 개요 : 다음 열거되어 있는 여러 구성 중 README.md를 제외하고는 파일명이 꼭 지켜질 필요는 없으나 관용적으로 사용됨 ⑵ README.md ① 깃허브 repository를 설명해주는 마크다운 문서 : 마크다운이므로 html 코드를 삽입할 수도 있음 ② 내용 형식은 자유이며 설치 방법, 사용 방법은 꼭 써주어야 함 ⑶ .py, .yml, .xml : 디렉토리 안에 있지 않은 파일들 ① .py : 파이썬 스크립트 파일 ② .yml : 깃허브 홈페이지를 만들 때 가장 코어 역할을 하는 _config.ym.. 공감수 2 댓글수 0 2023. 6. 12.
  • 【Python】 파이썬에서 아나콘다(Anaconda) 환경 조성 및 Jupyter 사용법 파이썬에서 아나콘다(Anaconda) 환경 조성 및 Jupyter 사용법 추천글 : 【Python】 파이썬 목차  1. 개요 [본문]2. Anaconda 설치 [본문]3. Anaconda Prompt (anaconda3) [본문]4. Jupyter 설치 [본문]5. 아나콘다 환경 공유하기 [본문] 1. 개요 [목차]⑴ Tensorflow, Keras 등은 파이썬에서 인공신경망을 구현하기 위해 만들어짐⑵ 2017년부터 R에서 실행 가능한 버전이 출시됨 ⑶ 맥북은 터미널을 제공하므로 자연스럽게 설치돼 있음⑷ Anaconda는 2020년 9월부터 200명 이상의 직원이 있는 기업 또는 정부 조직 사용자에게 서비스를 유료로 제공  2. Anaconda 설치 [목차]⑴ Windows 기준 ① 1단계. 설치 웹사이.. 공감수 3 댓글수 0 2023. 6. 5.
  • 【Python】 파이썬 주요 트러블슈팅 [41-60] 파이썬 주요 트러블슈팅 [41-60] 추천글 : 【Python】  파이썬 목차  41. ImportError: cannot import name 'mnist.data_utils'⑴ (grammar) 문제 상황 from mnist.data_utils import load_data...MNIST_data = h5py.File("mnist/MNISTdata.hdf5", 'r') ⑵ (grammar) 해결책 1. MNIST 데이터를 다운받은 뒤 다음과 같이 코드를 실행   MNIST_data = h5py.File("./MNISTdata.hdf5", 'r')X_train = np.float32(MNIST_data['x_train'][:])y_train = np.int32(np.array(MNIST_data['y_.. 공감수 1 댓글수 0 2023. 1. 28.
  • 【Python】 파이썬 주요 트러블슈팅 [21-40] 파이썬 주요 트러블슈팅 [21-40] 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 21. rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError: Error in library(ggplot2) : there is no package called 'ggplot2' ⑴ (package) 해결책 : R로 접속한 뒤 install.packages('ggplot2') 22. ERROR: pip's dependecy resolver does not currently take into account all the packages that are installed. This behavior is the source of the following dependency conflicts. stlearn 0... 공감수 2 댓글수 0 2022. 5. 9.
  • 【Python】 파이썬 목차 파이썬 목차 추천글 : 【컴퓨터과학】 컴퓨터과학 목차최근 수정 내역h5 파일로부터 피처를 출력하는 코드 (24.10.07)indentation 트러블슈팅 (24.10.04)Numpy 브로드캐스팅 (24.09.14)제7회 빅데이터분석기사를 취득한 경험을 바탕으로 작성한 글입니다.  Ⅰ. 개요파이썬 문법 Ⅱ. 파이썬 개발환경 조성리눅스 서버(Linux server)'pip'은(는) 내부 또는 외부 명령, 실행할 수 있는 프로그램, 또는 배치 파일이 아닙니다.파이썬에서 아나콘다 환경 조성 및 Jupyter 사용법 CUDA 및 tensorflow-gpu를 통해 딥러닝을 위한 GPU 환경 구축하기도커 사용하기파이썬에서 R 실행하기R에서 파이썬 실행하기 Ⅲ. 파이썬 IDE 설치주피터(jupyter)비주얼스튜디오(v.. 공감수 1 댓글수 0 2022. 5. 6.
  • 【Python】 파이썬 시각화를 위한 Bokeh 설치하기 파이썬 시각화를 위한 Bokeh 설치하기 추천글 : 【Python】 파이썬 앱 라이브러리 1. 개요 [본문] 2. Step 1. Node.js 설치하기 [본문] 3. Step 2. ipywidgets 설치하기 [본문] 4. Step 3. Bokeh 패키지 설치하기 [본문] 5. Step 4. jupyter_bokeh 패키지 설치하기 [본문] 6. Step 5. 간단한 코드 실행 [본문] 7. 트러블슈팅 [본문] a. 이산확률분포 시각화 b. 연속확률분포 시각화 1. 개요 [목차] ⑴ Ubuntu 18.04.6 LTS (GNU/Linux 5.4.0-81-generic x86_64) 기준으로 작성 ⑵ Bokeh는 direct하게 html을 빼주는 코드로 interactive plotting을 가능하게 함 ⑶.. 공감수 2 댓글수 0 2022. 3. 7.
  • 【Python】 CUDA 및 tensorflow-gpu를 통해 딥러닝을 위한 GPU 환경 구축하기 CUDA 및 tensorflow-gpu를 통해 딥러닝을 위한 GPU 환경 구축하기 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. 정식 방법 [본문] 2. 추천 방법 [본문] 1. 정식 방법 [목차] ⑴ 개요 ① GPU는 CPU에 비해 코어가 많아 대규모 데이터를 빠르게 처리할 수 있음 : 병렬 컴퓨터 관련 ② 다만, 데이터를 전송하는 속도는 GPU가 CPU보다 더 느릴 수 있음 ⑵ step 1. CUDA가 설치 가능한 GPU인지 확인 CUDA GPUs Your GPU Compute Capability Are you looking for the compute capability for your GPU, then check the tables below. NVIDIA GPUs power millions of .. 공감수 3 댓글수 0 2022. 1. 26.
  • 【Python】 파이썬 주요 트러블슈팅 [01-20] 파이썬 주요 트러블슈팅 [01-20] 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement cv2 (from versions: none) ERROR: No matching distribution found for cv2 ⑴ (package) 해결책 : pip install opencv-python 또는 (python3의 경우) pip3 install opencv-python 2. ModuleNotFoundError: No module named 'skimage' ⑴ (package) 해결책 : pip install scikit-image 3. AttributeError: module 'tensorflo.. 공감수 3 댓글수 0 2021. 12. 1.
  • 【Python】 파이썬 유용 함수 모음 파이썬 유용 함수 모음 추천글 : 【Python】 파이썬 목차, 【생물정보학】 생물정보학 분석 목차  1. 개요 [본문]2. 기초 함수 [본문]3. 수학 함수 [본문]4. 파일 입출력 [본문]5. 자료구조 [본문]6. 이미지 처리 [본문]7. 데이터 사이언스 [본문]8. 딥러닝 함수 [본문]9. 예외 처리 [본문]10. 생물정보학 [본문]a. 파이썬 문법b. 파이썬 앱 라이브러리c. R에서 유용한 주요 함수 모임  1. 개요 [목차]⑴ 아래에서 정의한 함수는 다음과 같이 호출할 수 있음 : GitHub에서 python으로 .py 파일을 호출하는 방법 ### Reference : https://changhsinlee.com/colab-import-python/import requests# Save data.. 공감수 2 댓글수 0 2020. 3. 24.
  • 【Python】 'pip'은(는) 내부 또는 외부 명령, 실행할 수 있는 프로그램, 또는 배치 파일이 아닙니다. 'pip'은(는) 내부 또는 외부 명령, 실행할 수 있는 프로그램, 또는 배치 파일이 아닙니다. 추천글 : 【Python】 파이썬 목차, 【Python】 anaconda3 및 jupyter 상에서 pip와 tensorflow 사용법 1. pip의 중요성 2. pip 명령어를 실행시키면 종종 마주치는 문제 3. pip 사용법 (정식 방법) 4. pip 사용법 (추천 방법) 1. pip의 중요성 ⑴ matplotlib 설치 : cmd 창에 다음과 같은 명령어를 입력한다. pip install matplotlib ⑵ numpy 설치 : cmd 창에 다음과 같은 명령어를 입력한다. pip install numpy 2. pip 명령어를 실행시키면 종종 마주치는 문제 'pip'은(는) 내부 또는 외부 명령, 실행할.. 공감수 34 댓글수 5 2019. 4. 20.
  • 【Python】 파이썬 기초 코드 파이썬 기초 코드 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 알고리즘 중심의 머신러닝 가이드, 스티븐 마슬랜드, 제이펍, 2016. 코드 1. a = 3 b = 2 print type(a/2) # print type(a/2.0) # a = b b = 3 print a // 2 print 'a' + 'd' # ad print 1 < a < 3 # True 코드 2. newlist = [3, 2, [5, 4, 3], [2, 3, 2]] print newlist[0] # 3 print newlist[2][1] # 4 print newlist[-2] # [5, 4, 3] print newlist[1:3] # [2, [5, 4, 3]] print newlist[0:4:2] # [3, [5, 4, 3]] print n.. 공감수 1 댓글수 0 2018. 6. 9.
  • 【Python】 파이썬 문법 파이썬 문법 추천글 : 【Python】 파이썬 목차 1. 개요 [본문]2. 문법 [본문]a. R 개요 1. 개요 [목차]⑴ 장점 1. 앱 개발 등에서 백엔드 구현이 용이함⑵ 장점 2. 딥러닝 툴이 잘 나와 있음⑶ 장점 3. 오픈 커뮤니티를 기반으로 다양한 어플리케이션이 가능⑷ 장점 4. 데이터 시각화가 상당히 잘 돼 있음  2. 문법 [목차]⑴ 파이썬은 여러 개의 값을 동시에 return할 수 있음 ⑵ yield는 값을 한 번에 모두 반환하지 않고, 필요한 시점에 하나씩 반환⑶ back space \ 를 통해 줄바꿈을 하여 multi-line code를 짤 수 있음 ⑷ 한 줄 문자열은 "~" 혹은 '~'로 나타내고, 여러 줄 문자열은 """~""" 혹은 '''~'''로 나타냄⑸ adata.var_name.. 공감수 1 댓글수 0 2016. 6. 23.
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