【화학정보학】 마커 물질 라이브러리

마커 물질 라이브러리

 

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1. 개요 [본문]

2. 분자경로 [본문]

3. 세포작용 [본문]

4. 생리작용 [본문]

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1. 개요 [목차]

⑴ 기타 부족한 정보는 수십억 개의 논문을 큐레이션 한 https://typeset.io/, https://www.scinapse.io/를 참고할 수 있음

 

 

2. 분자경로 [목차]

⑴ 아폽토시스 마커 

○ annexin-V staining 

○ TUNEL assay(terminal transferase dUTP nick-end labeling) 

○ γ-H2AX assay 

○ Calcein-AM assay

○ PI(propium assay)

○ Ki-67 assay

○ DAPI

○ CD8-PD1

○ caspase 3/7

○ PARP cleavage

○ 8-OHdG (8-hydroxy-2’-deoxyguanosine)

⑵ 기타 신호전달 매개 분자

○ Cdc42 : 많은 세포의 polarity를 조절하는, 진화적으로 잘 보존된 GTPase

 

 

3. 세포작용 [목차]

⑴ 소낭 활동 마커

○ clathrin-mediated endocytosis : transferrin

○ caveolae-mediated endocytosis : cholera toxin B subunit

○ macropinocytosis : 10 kDa dextran

○ endocytosis 

○ stabilin-1

○ stabilin-2

○ adaptor protein (AP2M1)

○ caprin-1 (가설)

○ SIDT2(Systemic RNA interference deficient-1 transmembrane family 2) (가설)

○ EGFR(epidermal growth factor receptor)

○ ESCRT-1 단백질 (e.g., TSG101(tumor susceptibility gene 101), VPS28)

○ endosome maturation

○ annexin A2

○ EGFR(epidermal growth factor receptor)

○ PKCα(protein kinase C-alpha)

○ ESCRT-1 단백질 (e.g., TSG101(tumor susceptibility gene 101), VPS28)

○ early endosome before endosomal escape : Rab5, APPL1, EEA1(early endosome antigen1)

○ early endosome during endosomal escape : Rab5, EEA1, Rab11 

○ recycling endosome : Rab11 

○ non-productive arrested endosome : EEA1

○ endosomal escape

○ galectin-3 

○ galectin-9 : galectin-3보다 더 뛰어남

○ COPII(coat protein complex II) (e.g., SEC31a, Sar1, STX5)

○ GCC2

○ M6PR(mannose-6-phosphate receptor)

○ Alix

○ late endosome

○ CD63 

○ Rab7

○ Rab9 : trans-golgi network로의 수송을 매개

○ LBPA(lysobisphosphatidic acid)

○ LAMP1 : lysosome-associated membrane protein 1

○ lysosome : LAMP1, Lysotracker (리소점 특이적 염색약)

○ autophagosome : LC3 (LC3B), LAMP1

⑵ structural marker

○ α-SMA (ACTA2, Acta2)

○ PanCK : 여러 종류의 세포골격을 식별할 수 있는 antibody cocktail 혼합물 

 

 

4. 생리작용 [목차]

⑴ 면역계 마커

○ 주요 면역계 마커 

○ CD274, PDCD1 : PD-L1/PD1 관련 마커

○ miRNA155 : APC maturation marker

○ SIINFEKL : MHC class marker

○ H-2kb : MHC class I marker

○ MHC II : APC marker

 

입력: 2022.09.09 14:08