【생물학】 생물학 노트

생물학 노트

 

추천글 : 【생물학】 생물학 목차

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1. IHC용 항체 조사

⑴ IF : cultured cell에서 staining용

⑵ IHC-Fr : frozen tissue에 대한 IHC

⑶ IHC-P : paraffin tissue에 대한 IHC

 

 

2. 암종 

○ RCC와 관련된 좋은 자료 

○ 구강 편평세포암(oral squamous cell carcinoma, OSCC)

○ 가장 흔한 두경부암(head and neck cancer)

○ 구강의 점막 상피에서 발생하는 암의 90% 이상을 차지

 

 

3. 환경오염과 생물

○ 개구리는 수질오염에 대한 경보 신호를 제공

○ 카나리아는 석탄광의 일산화탄소에 대한 경보 신호를 제공

○ 농약에 있는 아트라진(제초제)은 아로마타아제를 활성화시키는 내분비 교란 물질

○ 살균제나 제초제는 안드로겐 수용체 봉쇄 내분비 교란물질 : 생쥐의 잠복 고환증 야기

○ 다염소비페닐(PCB) : 전기기구, 플라스틱, 페인트 등에 많음. 저체중 출산, 조산과 유관

 

 

4. 기형 유발원(teratogen)

○ DES(diethylstilbestrol) : 합성 에스트로겐. 1941-71년, 유산 방지 약물, 임신 10주 이전에 복용하면 여아의 질암, 자궁암 증가, 생식기 기형, 면역계 이상 초래

○ 알코올 : 일반적인 기형 형성 물질로 태아 알코올 중독이 1/1000 빈도로 최다. 정신지체, 생장지연, 시력 약화, 소두, narrow eye slit, 낮은 콧대, 심장 및 장기 결함, 사지 및 생식기 비정형, 학습 부진, 행동 이상, 신경 과민, 주의력 결핍 장애

○ 흡연 : 체중 미달, 심장 이상, 무뇌증, 높은 태아 및 영아 사망률, 언청이, 장기 이상

○ 방사선 : X선, 라듐 등. 소두증, 정신지체, 골격 이상 등. 특히 임신 1기에 진단용 X선을 조심할 것

○ 탈리도마이드(thalidomide) : 1960년대 사용된 입덧 진정제, 사지 발달장애 (무지증, 단지증)

○ 코카인 : 체중 미달, 생장 지연, 주의 집중 장애, 시각 장애, 과민성, 호흡 장애, 유아 사망, 장기 기형, 심장 마비, 발작, 과용할 경우 자연 유산, 미숙아 출산, 사산

○ 레티놀 산 : 축 형성 영향 물질

○ 13-시스 레티놀 : 낭포성 피부질환 치료제, 기형아 출산

 

 

5. 환경호르몬 발생원

○ 비스페놀A : 합성수지 원료, 식품과 음료 캔의 내부 코팅

○ 프탈레이트 : 인공피혁, 식품 포장재

○ DDT : 농약, 합성 살충제

○ 다이옥신 : 쓰레기 소각, 염소 표백 및 살균 과정

○ 스티렌이성체 : 각종 식품용기

○ 알킬페놀 : 합성세제, 샴푸, 형광표백제

○ 트리부틸주석 : 선박용 페인트

 

 

6. 난소 낭종 파열

○ 난소 낭종 파열은 성관계로 인한 심한 출혈이 주요 원인 

 

 

7. 바이오마커

 

1. B2M mutations (rare)
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue or blood
6. NGS WES or targeted gene panel sequencing
2. Copy number variation
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. prognostic, predictive
4. multiple cancer types
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. NGS WES or targeted gene panel sequencing
3. Gut microbial diversity
1. Association : +
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : Oral or gut
6. PCR or NGS
4. HLA class I diversity
1. Association : +
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma and NSCLC
5. biomarker assessment : blood
6. NGS WES or PCR-based typing
5. JAK2 mutations (rare)
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue or blood
6. NGS WES or targeted gene panel sequencing
6. LOH at HLA class I alleles
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. TBD
7. Mutations in the β-catenin pathway
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue or blood
6. NGS WES, targeted gene panel sequencing or RNA-seq
8. PDL1
1. Association : +
2. phase III validation : Y
3. predictive
4. multiple cancer type
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. immunohistochemistry
9. SERPINB3 or SERPINB4 mutations
1. Association : +
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. NGS WES
10. Specific gut microbial species
1. Association : + or -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : oral or gut
6. PCR or NGS
11. STK11 mutation (common)
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. NSCLC
5. biomarker assessment : tumour tissue or blood
6. NGS WES or targeted gene panel sequencing
12. T cell-inflamed microenvironment
1. Association : +
2. phase III validation : TBD
3. prognostic, predictive
4. mutiple cancer types
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. NGS RNA-seq or immunostaining
13. T cell repertoire clonality change 
1. Association : +
2. phase III validaiton : TBD
3. predictive
4. melanoma
5. biomarker assessment : tumour tissue or blood
6. TBD
14. TGFβ expression
1. Association : -
2. phase III validation : TBD
3. predictive
4. colon cancer and urothelial cancer
5. biomarker assessment : tumour tissue
6. NGS RNA-seq or expression panel
15. Tumour mutation burden 
1. Association : +
2. phase III validation : Y
3. predictive
4. multiple cancer type
5. biomarker assessment : blood or tumour tissue
6. NGS WES or targeted gene panel sequencing

 

8. 시퀀싱 관련

○ Gene Expression은 Agilent 44 K mircroarray를 통해 확인

○ DNA copy number는 Affymetrix 250 K Sty와 SNP6 microarray를 통해 확인

○ DNA 메틸화는 MSNP microarray assay를 통해 확인

○ EGFR, KRAS, STK11, TP53은 ABI sequencer에 의해 절단

 

 

9. 빅파마 관련

○ antiamyloid에서 아두카누맙은 이미 안중에 없음

○ antiamyloid에서 후속으로 가장 빠른 donanemab, gantenerumab이 메이저

○ autoimmune 등 anti-inflammatory 쪽이 매출 높은 '스테디셀러'가 독점적 권한 형태로 오래 감

○ KRAS가 본격적으로 등장 

○ ATTR amyloidosis에서 Tafamidis 이후 경쟁 약물이 best-in-class를 두고 달려드는 게 많아짐

 

 

10. 중합효소는 Mg2+를 가지고 있다.

○ RNA 중합효소 : Mg2+ 두 개를 가져서 하나는 앞선 3'-OH의 O를 잡아주고, 다른 하나는 dNTP를 잡아줌

○ 분자생물학은 무조건 Mg라고 할 수 있는 정도

○ ribozyme은 Mg2+와 단백질 도움 필요

 

 

11. 체취에 대하여

○ 체취와 ABCC11 유전자

○ 나이가 들면 피지 속 지방산이 산화되면서 생성되는 노넨알데하이드라는 물질의 양이 증가하는데 모공에 쌓여 퀴퀴한 냄새를 풍긴다. 여기에 더해 40대 이후엔 피부 유익균 감소, 피부 산성화, 지질 성분 변화 등으로 노넨알데하이드 제거 능력은 점차 감소해 체취가 강해진다.

 

입력 : 2022.06.06 19:23

수정: 2023.06.07 13:28