【생물학】 약물 스크리닝 기술

약물 스크리닝 기술(drug screening technology)

 

추천글 : 【생물정보학】 약물 라이브러리 

---

1. Affymetrix GeneChip [본문]

2. Luminex bead arrays [본문]

3. 기타 [본문]

---

 

1. Affymetrix GeneChip : HG-U133 Plus 2.0 Array 등 [목차]

 

 

2. Luminex bead arrays (L1000) [목차]

⑴ 개요

⑵ Level 1. Raw (LXB) : 978 landmark gene에 대해서만

⑶ Level 2. GEX : 978 landmark gene에 대해서만

⑷ Level 3a. NORM : 12,328 genes (978개의 landmark + 11,350 inferred)

⑸ Level 3b. INF : 12,328 genes (978개의 landmark + 11,350 inferred)

⑹ Level 4. ZS (z-scoring) : 12,328 genes (978개의 landmark + 11,350 inferred)

⑺ Level 5. MODZ (moderate z-score)

⑻ 분석

① WTCS(weighted connectivity score)의 계산 

② NCS(normalized connectivity score)

③ Tau

⑼ 요약

① landmark gene, inferred gene 등의 리스트

② gene-space 

 

 

3. 기타 [목차]

⑴ Illumina Human HT-12 v4 Expression BeadChip Array

⑵ mRNA-seq (Illumina Hi-Seq)

⑶ GCP : histone profiling

⑷ P100 : phosphoproteomics

⑸ KINOMEscan

⑹ KiNativ

⑺ MEMA

⑻ ELISA

⑼ RPPA

⑽ ATAC-seq

⑾ Cellarium

⑿ SWATH-MS

 

입력 : 2022.07.18 22:11