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【유기화학】 28강. 분광학

 

28강. 분광학(spectroscopy)

 

추천글 : 【유기화학】 유기화학 목차


1. 개요 [본문]

2. 질량 분석법 [본문]

3. 적외선 분광법 [본문]

4. 자외선-가시광선 분광법 [본문]

5. 핵자기 공명 분광법 [본문]

6. 라만 분광법 [본문]

7. 기타 분광법 [본문]

8. 분광기기의 설계 [본문]


a. 분광학 예제


 

1. 개요 [목차]

적외선 분광법 : 적외선에 의한 분자의 진동을 관찰. 적외선을 입사한 후 동일한 파장의 적외선이 얼마나 변하는지를 관찰

⑵ 라만 분광법 : 가시광선 레이저를 쏘고 그 파장의 변화를 관찰

⑶ 광전자 분광법 : X선에 의한 전자 전이를 관찰

⑷ 마이크로파 분광법 : 마이크로파에 의한 분자의 회전을 관찰

⑸ 핵자기 공명법 : 라디오파에 의한 핵스핀 전이를 관찰

 

 

2. 질량 분석법(mass spectroscopy, MS) [목차]

⑴ 원리

Copyright ⓒ 2022 izgrimean

Figure. 1. 질량 분석법 도식]

 

① 1st. entrance region

1-1. 샘플 내 분자들을 입사함 : 분자들은 거의 다 중성

1-2. 분자들은 양의 전위를 갖는 금속 판을 통과함

② 2nd. ionization region

2-1. 질량분석기에서 전자빔(electron beam)을 통해 70 eV 에너지를 갖는 전자를 쏨

2-2. 이온화 단계(ionization) : 고에너지 전자와 충돌한 유기분자는 전자를 하나 잃고 분자이온을 생성

○ 분자이온의 질량 = 분자량

분자이온은 라디칼 형태를 취함 : M+ㆍ와 같이 표현할 수 있음

2-3. 조각화(토막내기, fragmentation) : 분자이온은 매우 불안정하여 라디칼 부분과 양전하를 띠는 부분으로 분해

작용기의 종류에 따라 선호하는 조각화 반응이 존재함

폴리펩티드의 조각화 : b는 NH2가 말단인 fragment를 의미하고, y는 -COOH가 말단인 fragment를 의미함

 

폴리펩티드의 조각화 예시
출처 : 이미지 클릭

Figure. 2. 폴리펩티드의 조각화 예시]

 

각 조각화된 이온별 형태
출처 : 이미지 클릭

Figure. 3. 각 조각화된 이온별 형태]

 

○ 두 피크가 정확히 28 Da 만큼 차이나는 경우 a-b pair 혹은 x-y pair일 것으로 추정

○ a 이온은 b 이온보다 더 적은 빈도로 나타남 : C≡O+는 C=N+보다 불안정하기 때문

2-4. 1가, 2가 등 여러 이온이 발생 : 대체로 1가 이온이 생성

3rd. acceleration region

3-1. 각각 0과 음의 전위를 갖는 금속판들 때문에 앞의 양의 전위를 띠는 금속판과 함께 전기장이 형성됨

3-2. 양전하 분자들은 전기장에 따라 점점 가속화됨 

오직 양전하 화학종만이 recorder에 도달

 

 

④ 4th. drift region

○ 양전하 분자들이 음의 전위를 갖는 금속판을 통과하면 전기장이 걸리지 않는 drift region 상에서 직선으로 운동

⑤ 5th. detector region

종류 1. reflectron mode : Figure. 1.이 해당

○ 원리 : 로렌츠 힘

○ 즉, 이온들을 자기장에 통과시키면 m/z에 따라 다르게 detector에 도달할 수 있음

종류 2. linear mode

○ 대표적으로 QMS(quadruple mass spectrometry)가 있음

○ QMS에서는 RF를 통해 진동하는 전기장을 제공하여 m/z에 따라 다르게 detector에 도달할 수 있음

원리 1. TOF(time-of-flight) mass analyzer

 m/z에 따라 이온들이 detector에 도달하는 시간이 달라지는 원리를 이용

○ 즉, 질량이 작은 이온이 질량이 큰 이온보다 detector에 더 빠르게 도달함 

원리 2. LC(liquid chromatography) analyzer

○ 전체 m/z가 아니라 특정 m/z만을 선택적으로 받아들일 수도 있음 (예 : MS/MS)

한 순물질도 여러 이온을 만듦으로 여러 m/z를 가질 수 있음 : deconvolution 알고리즘을 통해 single peak으로 만듦 

⑵ 질량 분석의 해석

① 질량 분석에서 가장 높은 피크를 주 피크(base peak)라고 함

② 주 피크를 100으로 정하고 나머지를 상대값으로 측정

③ m/z의 예시 : 양전하 화학종이 안정할수록 피크가 크게 나타남

 

m/z의 예시
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 4. m/z의 예시]

 

④ 질소 규칙(nitrogen rule)

○ C, H, O의 원소들로 이루어진 탄화 수소는 항상 짝수의 분자량을 가지기 때문에 분자이온도 짝수임

 유기분자에서 홀수의 분자 이온의 수치가 나타났다면 홀수 개의 질소 원자를 포함한다고 볼 수 있음

○ 예시 : 위의 예시에서 m/z가 홀수인 것은 proton transfer를 고려하지 않았기 때문 (MALDI-TOF 참고)

○ CH4 : 16

○ CnH2n+2 : 짝수

○ CnH2n : 짝수

○ CnH2n-2 : 짝수

○ -H를 -OH, -F, -Cl, -Br, -I, -SH, -SiH3 치환기로 대체한 경우 : 짝수

○ -H를 -NH2 치환기로 대체한 경우 : 홀수 

⑶ 질량 분석과 동위원소

고해상도 spectrometer는 동위원소를 구별할 수 있음

 

원소 풍부도
탄소 12C 98.89%, 13C 1.11%
수소 1H 99.99%, 2H 0.01%
질소 14N 99.64%, 15N 0.36%
산소 16O 99.76%, 17O 0.04%, 18O 0.20%
32S 95.0%, 33S 0.76%, 34S 4.22%, 36S 0.02%
플루오린 19F 100%
염소 35Cl 75.77%, 37Cl 24.23%
브롬 79Br 50.69%, 81Br 49.31%
아이오딘 127I 100%

Table. 1. 유기물에서 발견되는 동위원소의 풍부도 (natural abundance)

 

② Cl은 질량 35와 37이 3 : 1의 비율로 존재

③ Br은 질량 79와 81이 1 : 1의 비율로 존재

④ M과 M+2의 높이차로 어떠한 원소가 포함돼 있는지 판단할 수 있음

종류 1. MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization) : 이와 관련해 Koichi Tanaka가 노벨상 수상

1st. 샘플(M)을 matrix와 섞은 뒤 matrix에 nitrogen laser lighter (337 nm)를 쬐면 열이 발생

② 2nd. 발생된 열로 인해 matrix가 샘플과 같이 기화함 

③ 3rd. matrix는 기화함과 동시에 protonated됨 : M → MH+

④ 4th. A(anion)와의 proton transfer : MH+ + A → M + AH+

 

출처 : ⓒ 2022 izgrimean

Figure. 5. MALDI-TOF의 원리]

 

고체 시료를 대상으로 함. 대략 1가, 2가, 3가 정도까지만 신호 갈라짐이 발생함 

 

IgG의 MALDI-TOF 질량분석 결과 (deconvolution 하기 전)
출처 : 서울대학교 임상단백질체학 (Eugene C. Yi 교수님)

Figure. 6. IgG의 MALDI-TOF 질량분석 결과 (deconvolution 하기 전)]

 

종류 2. ESI(electron spray ionization) : 이와 관련해 John B. Fenn이 노벨상 수상 

HPLC를 거친 액체 시료가 nebulizer gas로 둘러싸인 고전압 관을 통과하면 spray 형태로 분사됨

액체 시료를 대상으로 함. 꽤 많은 신호 갈라짐이 발생함 

 

 

트립시노겐(Mw : 23983)의 ESI 질량분석 결과 (deconvolution 하기 전)
출처 : 서울대학교 임상단백질체학 (Eugene C. Yi 교수님)

Figure. 7. 트립시노겐(Mw : 23983)의 ESI 질량분석 결과 (deconvolution 하기 전)]

 

⑹ 응용 : 질량분석기의 정량 (단백질 분석을 중심으로)

① 배경 : 질량분석기는 그 자체로 정량적이지 않아 여러 기법이 개발됨

이유 1. 측정 spot에 따라 laser power가 다를 수 있음

이유 2. 물질마다 이온화 정도가 다르기 때문

종류 1. 상대적 정량

1-1. labeling

ICAT(isotope-coded affinity tag) : chemical

○ 구조 : affinity tag (biotin) + linker region (light: 8 1H, heavy: 8 2H) + cysteine binding motif (iodoacetamide)

○ 가정 : target protein에 Cys가 포함돼 있음

○ 원리 : 실험 조건에 따라 선택적으로 light linker를 표지시키고 다른 조건에서 표지시킨 heavy linker와 비교

○ 1st. 한 실험군에는 light ICAT tag를 붙이고 다른 실험군에는 heavy ICAT tag를 붙임 

○ 2nd. 각 실험군에서 얻은 단백질들을 한데 모아 avidin affinity chromatrography를 수행

○ 3rd. tagged protein 선별 수집 : tag는 Cys를 포함하는 protein에만 결합하므로 많은 단백질들이 제거 

○ 4th. LC/MS를 수행  

 labeling이 일어나는 단계 : protein

단점 1. target protin과 streptavidin을 분리하기 어려움

단점 2. biotin 태크가 protein보다 쉽게 fragmentation이 되기 때문에 biotin으로 인한 신호간섭이 생김

SILAC(stable isotope labelling with amino acids in cell culture) : metabolic 

○ 용도 : protein expression study, unbiased analysis of post-translational modificiation

○ 1st. heavy 측 cell culture : 13C, 15N-Arg, 13C-Lys를 제공

○ 2nd. light 측 cell culture : 12C, 14N-Arg, 12C-Lys를 제공

○ 3rd. 각각에서 얻은 추출물을 한데 모은 뒤 LC(liquid chromatography) / MS / MS를 수행

○ 4th. spectrum을 통해 식별 및 상대적 정량

○ labeling이 일어나는 단계 : cell

장점 1. 동일한 단백질에서도 약간씩 신호가 달라지므로 데이터 분석시 신뢰성 있는 보정이 가능함

장점 2. 별도의 labeling reaction을 하지 않아도 자연스럽게 labeling이 됨 

장점 3. cell 자체의 labeling, 즉 global scale에서의 분석이 가능함 

단점 1. multiplexing이 3개로 제한 

단점 2. 스펙트럼에서 신호가 겹치게 되면 heavy 측 신호인지 light 측 신호인지 구분할 수 없게 됨

○ BEMAD(β-elimination followed by Michael addition of DTT) : chemical  

○ DTT는 환원제로 기능하여 단백질 내 이황화결합(-S-S-)을 제거 (-SH)

○ 원리 : DTT 대신 2H6-DTT를 처리한 후 스펙트럼에서 상대적 비교

 labeling이 일어나는 단계 : protein

16O / 18O : enzymatic

○ 원리 : 트립신이 있는 조건에서 물에서 hydration 시킬 때의 생성물들을 보고 분석하는 방식

 labeling이 일어나는 단계 : protein 

15N : metabolic 

 labeling이 일어나는 단계 : protein 

1-2. label-free

○ peak intensity

○ spectral counting

○ spectral TIC

종류 2. 절대적 정량

2-1. labeling

iTRAQ(isobaric tag for relative and absolute quantitation) : chemical 

○ iTRAQ reagent : reporter group (cationic) + balance group (neutral) + amine binding motif (NHS)

○ reporter group과 balance group를 통틀어 isobaric tag라고 함

상대적 정량 원리 : reporter group, balance group를 달리 하여 스펙트럼에서 peak의 위치가 달라지게 함

절대적 정량 원리 : 각각의 추출물 내 reporter group의 전하량을 측정함

 labeling이 일어나는 단계 : peptide

○ 장점 : 비교적 자유롭게 multiplexing이 가능함. 상대적 정량과 절대적 정량이 모두 가능함

○ 단점 : 아민을 반드시 포함하는 물질에서만 사용 가능. SILAC과 달리 global scale에서 비교가 불가능함

○ MRM 

○ TMT 

2-2. label-free

APEX

④ 상대적 정량 방법이라고 해도 절대적 정량이 될 수 있음

방법 1. 양을 알고 있는 labeling된 물질과 양을 알고자 하는 물질을 함께 섞은 뒤 상대적 정량

 방법 2. calibration curve를 그리는 방법 

⑺ 응용 : MS/MS (MS2, tandem mass spectrometry)

정의 : 두 개의 mass spectrometer를 붙여 놓은 것

○ 일반적으로 triple-quadruple 구조를 이용함 (linear detector 모드)

구성 1. MS1 (quadruple 구조; Q1) : 주어진 샘플을 이온화한 뒤 특정 m/z를 갖는 이온 X를 분리함

○ MS1을 통과한 이온을 precursor ion이라고 함

구성 2. fragmentation part (quadruple 구조; Q2) : 특정 m/z를 갖는 이온 X를 더 작은 fragment들로 쪼갬

구성 2에 있어 CID(collision-induced dissociation), ion-molecule reaction, photodissociation 등의 방법이 쓰임

구성 3. MS2 (quadruple 구조; Q3) : 특정 m/z를 갖는 fragment를 분리함

○ MS2를 통과한 이온을 product ion이라고 함

MS/MS로 인해 얻을 수 있는 신호의 종류가 굉장히 다양해짐

○ 각 fragment들의 m/z의 신호를 재조합하여 이온 X의 m/z 값을 추산할 수 있음 : 알고리즘의 영역

종류 1. shotgun 기법

○ 정의 : MS1 및 MS2에서 filtering을 거치지 않고 모든 화학종의 스펙트럼을 알아내는 기법

○ 전체 단백질의 상대적 분포를 알아내는 shotgun proteomics 등에서 사용됨

○ 단점 : 시간이 오래 걸림. sensitivity가 낮음. 제한된 시간으로 인해 구체적인 m/z 값을 조사하지 못함

1-1. DDA(data-dependent acquisition) 방식 : MS1으로부터 single peak를 고른 뒤 MS2를 하는 방식. 시간소요 큼

1-2. DIA(data-independent acquisition) 방식 : MS1으로부터 peak range를 고른 뒤 MS2를 하는 방식

 

DDA 방식과 DIA 방식의 비교
출처 : ChemBioChem, 20(10), 1210-1224.

Figure. 8. DDA 방식과 DIA 방식의 비교]

 

종류 2. SRM(selected reaction monitoring)

○ 정의 : 특정 m/z를 갖는 fragment의 스펙트럼을 알아내는 기법

○ 장점 : 자동화, 항체 구입 불필요, sensitivity ↑ (background interference ↓), selectivity ↑, dynamic range ↑

○ 단점 : 절대적 정량에 한계가 있음 

종류 3. MRM(multiple reaction monitoring)

○ 정의 : 하나 또는 그 이상의 precursor ion으로부터 하나 또는 그 이상의 product ion의 스펙트럼을 알아내는 기법

○ SRM과 MRM을 넓은 의미의 SRM으로 포함시키기도 함

⑻ 응용 : McLafferty rearrangement

 

Figure. 9. McLafferty rearrangement

 

특징 1. hydrogen radical이 이동

특징 2. 6각 고리 전이상태 

특징 3. 중성인 알켄과 라디칼 양이온으로 분해

 

 

3. 적외선 분광법(infrared spectrum, IR spectrum) [목차]

⑴ 정의 

적외선의 흡수파장을 분석하여 화합물의 작용기를 분석하는 실험방법

pH 센서 등으로 이용됨 

③ IR spectrum을 AI로 예측하는 모델이 개발되고 있음

⑵ 진동 : 전자의 출렁거림, 신축 진동과 굽힘 진동으로 구분

① 적외선 흡수파장은 중적외선(2,500-8,000 nm) 영역

② 중적외선은 흡수량이 많아 신호 세기가 약하므로 일반적으로 근적외선을 사용

③ 중적외선을 이용한 구현을 시도하고 있음

유형 1. 신축 진동(stretching vibration)

① 정의 : 전기음성도가 큰 원자에서 전기음성도가 작은 원자로 전자가 일시적으로 이동하는 것

② 종류 : symmetric stretch, asymmetric stretch

③ IR 분광법은 대부분 신축 진동과 관련이 있음

④ 쌍극자 모멘트가 있는 원자는 적외선을 흡수하여 쌍극자 모멘트의 크기가 작아짐

○ 역으로 IR 분광법에서 쌍극자 모멘트의 변화량이 있어야 적외선을 흡수

⑤ 흡수하는 적외선 파장은 양자화되어 있음

⑥ IR에서는 적외선 흡수선을 파장 (cm)의 역수인 파수(cm-1)로 나타내며 일반적으로 4000-400 cm-1

○ (참고) 521 cm-1는 1 cm에 521개의 파동이 들어있는 경우를 지칭함

요인 1. 결합이 강할수록 더 많은 에너지가 필요하므로 파수 증가

○ E = hν(단, ν는 파수)와 밀접한 관련  

○ C≡C > C=C > C-C

○ 2-pentanone에서 C=O 결합은 이중결합이므로 1720 cm-1의 파수 관찰

○ 2-cyclohexanone에서 C=O 결합은 공명으로 인해 차수가 2보다 작으므로 1680 cm-1의 파수 관찰

요인 2. 작은 원자일수록 전자의 분산이 덜하므로 파수 증가

요인 3. 쌍극자가 클수록 결합이 강하므로 파수 증가

○ O-H > N-H > C-H

○ (주석) 이때 쌍극자는 단일 결합의 쌍극자를 말하는 것으로, 분자 전체의 쌍극자를 지칭하는 것은 아님 (ref

요인 4. 수소결합이 있으면 분자간 결합이 분자내 결합과 유사하고 수소결합의 형태가 다양하므로 흡수선이 매우 넓어짐

○ OH 결합은 수소결합으로 넓은 스펙트럼으로 관찰됨

⑪ 주요 작용기별 신축진동 흡수 파수

 

결합 종류 파수 (cm-1) 강도
C≡N 2260-2220 중간
C≡C 2260-2100 중간-약함
C=C 1680-1600 중간
C=N 1650-1550 중간
벤젠 ~1600, ~1500-1430 강함-중간
C=O 1780-1650 강함
C-O 1250-1050 강함
C-N 1230-1020 중간
O-H (알코올) 3650-3200 강함, 넓음
O-H (카르복실산) 3300-2500 강함, 매우 넓음
N-H 3500-3300 중간, 넓음
C-H 3300-2700 중간
C≡C-H ~3300  
C=C-H 3100-3020  
C-C-H 2960-2850  
R-CHO ~2820, ~2720  

Table. 2. 주요 작용기별 신축진동 흡수 파수

 

종류 2. 굽힘 진동(bending vibration, deformation vibration)

① 정의 : 결합각이 일시적으로 바뀌는 것

② 종류

○ symmetric in-plane bend (scissor)

○ asymmetric in-plane bend (rock)

○ symmetric out-of-plane bend (twist)

○ asymmetric out-of-plane bend (wag)

③ 주로 탄소-수소 결합에서 나타남

④ 굽힙 진동은 신축 진동보다 에너지를 덜 요구하기 때문에 파수가 작은 편

⑤ 주요 작용기별 굽힘진동 흡수 파수

 

결합 종류 명칭 파수 (cm-1)
CH3-   1385-1365
-CH2-   1450-1420
-CHR-   1450-1420
HR-C=C-RH trans 980-960
RH-C=C-RH cis 730-675
R2-C=C-RH trisubstituted 840-800
R2-C=C-H2 terminal alkene
(disubstituted)
890
RH-C=C-H2 terminal alkene
(monosubstituted)
990, 910

Table. 3. 주요 작용기별 굽힘진동 흡수 파수

 

종류 3. 회전에너지 : 회전에너지는 진동에너지 준위를 보다 세분화한 수준

⑹ 예시 : 예시의 나열 순서는 유기화학 목차에 따른 순서임

예시 1. 알코올(alcohol)

 

알코올의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 10. 알코올의 IR 분광법

 

○ 3400 : -OH

○ 1060 : C-O

예시 2. 2-propyn-1-ol

 

2-propyn-1-ol의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 11. 2-propyn-1-ol의 IR 분광법

 

○ 3300 : OH기

○ 2950 : sp3 CH

○ 2100 : 알카인

예시 3. 디에틸에테르(diethyl ether)

 

디에텔에테르의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 12. 디에텔에테르의 IR 분광법

 

예시 4. 케톤(ketone)

 

케톤의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 13. 케톤의 IR 분광법]

 

○ 1720 : C=O

○ finger region

예시 5. 알데하이드(aldehyde)

 

알데하이드의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 14. 알데하이드의 IR 분광법

 

○ 2700, 2800 : C-H

○ 1720 : C=O

예시 6. 벤즈알데히드(benzaldehyde)

 

벤즈알데히드의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 15. 벤즈알데히드의 IR 분광법

 

○ 3050 : sp2 CH

○ 2810, 2730 : 알데하이드의 특징적인 twin peaks

○ 1700 : partial single-bond character carbonyl

○ 1600, 1460 : 벤젠 고리

예시 7. 카르복실산(carboxylic acid)

 

카르복실산의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 16. 카르복실산의 IR 분광법

 

○ 3200, 2600 : -OH

○ 3000 : C-H

○ 1700 : C=O

○ 1200 : C-O

예시 8. 에스터(ester)

 

에스터의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 17. 에스터의 IR 분광법

 

○ 1760 : C=O

○ 1100, 1200 : C-O

○ finger region

예시 9. 아마이드(amide)

 

아마이드의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 18. 아마이드의 IR 분광법

 

○ 1660 : C=O

○ finger region

예시 10. N-methylethanamide

 

N-methylethanamide의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 19. N-methylethanamide의 IR 분광법

 

○ 3300 : N-H 신축진동

○ 2950 : sp3 CH

○ 1660 : amide carbonyl

○ 1560 : N-H 굽힘진동

예시 11. 아민(amine)

 

아민의 IR 분광법
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

Figure. 20. 아민의 IR 분광법

 

○ 3400, 3300 : N-H 신축진동

○ 1600 : N-H 굽힘진동

○ finger region 

응용 1. vibrational-rotational spectrum  

① 정의 : IR 분광법 혹은 라만 분광법을 통해 얻은 vibration, rotation에 관한 정보를 도식화 한 것

② R-branch : ΔJ = 1. Δv = 1

 

 

4. 자외선-가시광선 분광법(UV-vis spectrum) [목차]

원리 1. 흡수파장의 결정

 π 결합은 자외선-가시광선을 흡수할 수 있으며 conjugation 길이가 길어지면 흡수파장이 길어짐

② π 결합 전자가 자외선-가시광선을 흡수하면 π* 오비탈로 이동

원리 2. 비어-램버티 법칙(Beer-Lambert law)

① 증명

 

 

○ I : 빛의 세기

○ d : 빛이 투과하는 경로의 길이

○ a : 매질에 따른 흡광계수

○ T : 투과율

○ A : 흡광도 (단위 : OD(optical density))

○ c : 몰농도

○ ε : 몰 흡광계수

② 결론 : 흡광도는 물질의 농도에 비례

⑶ 흡수파장에 따른 흡수색, 관찰색

 

흡수파장 (nm) 흡수색 관찰색
380-460 blue-violet yellow
380-500 blue orange
440-560 blue-green red
480-610 green purple
540-650 orange blue
380-420, 610-700 purple green

Table. 4. 흡수파장에 따른 흡수색, 관찰색

 

⑷ 흡수파장 예시

① 화학물질

○ methyl vinyl ketone : 219

○ 3,5-hexadien-2-one : 249

○ anilinium ion : 254

○ benzene : 255

○ phenol : 270

○ aniline : 280

○ phenolate ion : 287

② 생체 유래 물질

○ 핵산의 질소 염기 : 260

○ Phe, Trp, Tyr에만 있는 페닐기 : 280

○ NADH : 340

○ 닌히드린(ninhydrin) : 405 ㎚. 닌히드린은 아미노산과 반응하여 흡수파장이 570 ㎚인 보라색 산물을 형성

β-carotene : 455 ㎚

○ lycopene : 474

○ 카로티노이드 : 500

○ 헤모글로빈 : 560

○ 엽록소 : 680 ㎚, 700

○ 광합성 세균(예 : 홍세균)의 색소분자 : 840 ㎚, 870

 

 

5. 핵자기 공명 분광법(nuclear magnetic resonance, NMR) [목차]

⑴ 원리

1H, 13C, 15N, 19F, 31P와 같이 스핀양자수가 0이 아닌 화학종은 NMR의 대상이 될 수 있음

② 위와 같은 화학종은 외부 자기장이 인가되면 몇 가지의 양자화된 상태를 가짐

③ 각 상태 간에 에너지 차이에 해당하는 전자기파는 라디오파임

④ NMR을 통해 알 수 있는 정보 : 특정 화학종의 종류와 개수

⑤ 일반적으로 MRI에서 voxel 사이즈는 1 × 1 × 5 ㎣인 반면 MRS는 15 × 15 × 15 ㎣로 비교적 큼

1H NMR (proton NMR)

1H는 자기장 B0에 대해 α-spin state와 β-spin state의 두 가지 양자화된 상태를 가짐

 

자기장에 대한 두 가지 양자화된 상태
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc. Paula Yurkanis Bruice

Figure. 21. 자기장에 대한 두 가지 양자화된 상태]

 

② 스핀 반전(spin flip) : 1H는 자기장의 크기에 비례하는 에너지를 흡수하면 α-spin state에서 β-spin state로 흥분됨

원리 1. 적분비(integral ratio)

○ NMR 신호의 적분비는 해당 equivalent 1H의 개수비를 나타냄

○ 이유 : 신호는 equivalent 1H의 개수에 선형 비례함. 다른 요인에는 크게 영향을 받지 않음

원리 2. 화학적 이동(chemical shift)

렌츠의 법칙 : 외부 자기장의 변화가 있으면 전자는 그 자기장을 상쇄하는 방향으로 유도 자기장을 형성함

화학적 가리움(chemical shielding) : 국소적인 자기장 변화로 기본 자기장 B0에 비례

 

 

Bi : 국소 자기장

σi : 양성자 i에 대한 가리움 효과를 반영하는 인자

○ 가리움 인자는 일반적으로 작기 때문에(10-4 ~ 10-6), 자기장의 차이는 매우 작음

○ 자기장 차이를 반영하기 위해 절대적인 값을 이용하는 것보다 비율을 이용

○ 지수 계산 : 국소 자기장과 기준 주파수의 차이를 기준 주파수로 나눈 것. ppm 단위를 흔히 사용

 

 

○ 자기장 차이를 표현한 이 항을 화학적 이동(chemical shift)이라고 부름

ωref의 값은 임의적이지만, 대개 transmitter의 ωTR를 선

○ 주된 장점 : B0에 독립적

예제 : 어떤 300 MHz 1H 핵자기공명(NMR) 스펙트럼에서 아세톤은 트라이메틸실레인(TMS) 기준으로부터 화학적 이동 δ 값이 2.0인 단일 공명선(single resonance line)으로 나타났다. 이 아세톤의 단일 공명선은 TMS 기준으로부터 몇 Hz 떨어져 있는가? 600 Hz

○ 전자 결핍 환경에 있는 1H는 알짜 자기장이 크므로 공명주파수 및 δ 값이 큼

○ (참고) 전자 결핍 환경에 있는 1H를 deshielded proton 또는 downfield proton이라고 함

○ 벗겨짐 효과(deshielding effect)와 관련 있음

○ 전자 풍부 환경에 있는 1H는 알짜 자기장이 작으므로 공명주파수 및 δ 값이 작음

○ (참고) 전자 풍부 환경에 있는 1H를 shielded proton 또는 upfield proton이라고 함

○ 가리움 효과(shielding effect)와 관련 있음

○ 전기음성도가 큰 원자에 가까운 1H일수록 더 많이 deshield되어 δ값이 커짐

○ 예 : CH3CH2CH2NO2에서 H는 1.04 ppm, H는 2.07 ppm, H는 4.37 ppm임

○ 예 : methyl proton은 0.85 ppm, methylene proton은 1.20 ppm, methine proton은1.55 ppm임

원리 3. 스핀-스핀 갈라짐(spin-spin splitting) : 짝지움, 커플링(coupling), 다중도(multiplicity)라고도 함

○ 특정 1H 주변에 n개의 equivalent 1H가 있을 때 그 1H에 의한 NMR 신호는 이항분포를 따름

배경 1. 주변에 있는 각 1H가 α-spin state와 β-spin state 중 하나의 상태를 취할 수 있으므로

배경 2. 주변에 있는 각 1H의 상태에 따라 그 특정 1H에 의한 NMR 신호가 영향을 받음

ortho 배향 수소 > meta 배향 수소 > para 배향 배향 수소 순으로 갈라짐에 영향을 줌 : 가까울수록 갈라짐이 증가

 

수소의 배향에 따른 짝지움 상수
출처 : 이미지 클릭

Figure. 22. 수소의 배향에 따른 짝지움 상수]

 

ortho 배향 수소만 있는 경우

○ 그 1H에 의한 NMR 신호는 총 n+1개로 구분돼고 k번째 신호의 크기비는 nCk에 비례함

○ 갈라짐의 개수에 따라 singlet, doublet, triplet, quartet, quintet, sextet, septet, octet, nonet 등으로 구분됨

⑥ 실제 1H NMR

○ TMS(tetramethylsilane) : 참조 물질로 사용되어 이 물질의 신호를 0 ppm으로 설정함

○ 다른 1H NMR의 신호의 δ 값은 TMS에 대해 상대적으로 나타냄

 

 

이유 1. 주파수 값 자체가 큼

이유 2. δ 값은 자기장에 비의존적임 ( 주파수가 자기장에 비례하기 때문)

○ chemical shift의 예시 : 벤질 수소 = 6.5-8, 알데하이드 수소 = 9.0-10을 암기할 것

 

1H의 chemical shift의 예시
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

 Figure. 23. 1H의 chemical shift의 예시]

 

1H NMR 예제 (ref)

13C NMR

원리 1. 적분비(integral ratio)

원리 2. 화학적 이동(chemical shift) : 220 ppm 이후

원리 3. 스핀-스핀 갈라짐(spin-spin splitting)

실제 13C NMR

TMS(tetramethylsilane) : 참조 물질로 사용되어 이 물질의 신호를 0 ppm으로 설정함

○ 여러 물질의 13C NMR : R-CH3 = 0-35, C-O = 50-90, 벤젠 = 110-170, C=O = 205-220을 암기할 것

 

13C NMR의 chemical shift의 예시
출처 : ⓒ 2016 Pearson Education, Inc.

 Figure. 24. 13C NMR의 chemical shift의 예시]

 

13C NMR 예제 (ref)

 

 

13C NMR 예제
출처 : 2012 MEET/DEET 자연과학 II

 Figure. 25. 13C NMR 예제]

답은 ①임

 

○ A : Cl 자리(2개), Cl 옆 자리(2개), Cl 옆옆 자리(2개) 등 총 세 개의 탄소 자리가 존재함

○ B : Cl 자리(2개), 오른쪽 Cl 옆 자리(1개), 왼쪽 Cl 옆 자리(2개), Cl 옆옆 자리(1개) 등 총 네 개의 탄소 자리가 존재함

○ C : Cl 자리(2개), Cl 옆 자리 (4개) 등 총 두 개의 탄소 자리가 존재함

 

 

6. 라만 분광법(Raman spectroscopy) [목차]

⑴ 정의 : 가시광선 레이저를 쏘고 그 파장의 변화를 관찰하는 것

 

FTIR(위)과 라만 분광법(아래)의 차이
출처 : Introduction to Mechatronics and Measurement Systems-Alciatore, D.G and Histand, M.B.-McGraw-Hill-2012

Figure. 26. FTIR(위)과 라만 분광법(아래)의 차이]

 

⑵ (참고) 비탄성 산란(inelastic scattering) : 라만 산란(Raman scattering)이라고도 함

① 정의 : 산란 시 에너지 변화가 있는 경우. 입사 파장과 산란 파장이 다름

② 레일리 산란에 대하여 얼마만큼 shift 됐는지에 따라 Raman shift로 표시함

적외선 분광법과 같이 직접적으로 진동 에너지를 측정할 수 없음

○ Raman shift의 단위는 cm-1

③ 양자역학적 이해 : 라만 산란 전후의 에너지 차이가 분자의 진동 에너지와 대응함

○ 물질이 에너지를 얻는 경우를 Stokes 산란이라고 함

○ 물질이 에너지를 잃는 경우를 anti-Stokes 산란이라고 함

○ 바닥 상태에 있는 분자가 진동 여기 상태에 있는 분자보다 많기 때문에 Stokes 산란이 anti-Stokes 산란보다 많음

⑶ Raman spectrum fingerprint region

 

Raman spectrum fingerprint region
출처 : 이미지 클릭

Figure. 27. Raman spectrum fingerprint region]

 

⑷ 분광 과정

① 1st. 샘플에 단색광을 쬐어줌

② 2nd. 라만 산란광과 레일리 산란광을 모두 notch filter에 통과사킴 : 산란광은 대부분 레일리 산란광임

③ 3rd. notch filter는 레일리 산란광을 선택적으로 차단함

④ 4th. notch filter를 통과한 라만 산란광은 grating을 통해 파장에 따라 분리됨

⑤ 5th. 이렇게 분리된 특정 파장의 라만 산란광을 CCD로 읽어 들임

⑸ 가시광선 파장을 인체 피부에 사용하면 형광이 심해 형광 피크에 가려 라만 산란에 의한 스펙트럼을 관찰할 수 없음

대책 1. 긴 파장을 사용하여 형광간섭을 감소시키는 것

예 1. Nd:YAG 레이저를 이용한 near-IR FT 라만 분광법 : 파장이 1064 nm

예 2. CCD (charge coupled device) 검출기를 이용한 분산형 라만 분광학

대책 2. 짧은 파장을 사용하여 형광 영역이 라만 스펙트럼 영역 밖에서 분리되도록 함

예 1. 자외선 공명 라만 분광(UVRR, ultraviolet-resonance Raman spectroscopy)

 

 

7. 기타 분광법 [목차]

⑴ surface plasmon resonance spectroscopy

표면 플라즈몬 공명(SPR, surface plasmon resonance)의 원리 

refractive index microscopy 

 

 

8. (참고) 분광기기의 설계 [목차]

⑴ 정의 : 주어진 대상체에 복사선을 쪼였을 때 대상체의 반사, 투과, 흡수, 산란, 형광을 파장별로 측정하기 위한 장치

구성 1. 광원(light source)

구성 2. 파장 선택기 : 프리즘, 회전발, 광학 필터 등이 있음

⑷ 회전발(diffraction grating)

① 정의 : 매끈하게 연마된 금속면에 톱니 모양의 홈을 파서 만든 것

○ 자외선과 가시광선 영역에 사용되는 반사 회전발은 1 mm 당 홈의 수가 300 ~ 6,000개임

○ 적외선 영역에 사용되는 반사 회전발은 1 mm 당 홈의 수가 10 ~ 200개임
○ 홈들은 모두 크기가 같고 평행하며 등 간격이어야 함

② 에셀레트형 회전발(echellette type diffraction grating)

○ 평행화 된 복사선이 회전발의 반사면에 닿으면 각 면에서 반사법칙이 일어남

○ 반사된 복사선들 사이에 상호 간섭이 일어남

○ 인접하는 복사선의 진행거리의 차이가 복사선 파장의 정수배가 되면 보강간섭이 일어남

 

에셀레트형 회전발의 보강간섭 조건
출처 : 이미지 클릭

Figure. 28. 에셀레트형 회전발의 보강간섭 조건]

 

⑷ 광학 필터

① 간섭 필터(interference filter)

○ 반투명한 2개의 박막 사이에 채워진, 얇고 투명한 유전체 층으로 구성됨

○ 브래그 회절(Bragg diffraction) : 유전체 층 두께가 작을수록 입사각이 클수록 복사선의 파장이 증가

 

브래그 회절
출처 : 이미지 클릭

Figure. 29. 브래그 회절]

 

 

○ 브래그 회절은 XRD(X-ray diffraction)의 원리가 됨

○ 특징 : 유효파장 폭(FWHM, full width at half magnitude)이 작음

② 흡수 필터(absorption filter)

○ 전체적으로 입사광을 약하게 하는 필터

○ 특징 : 유효파장 폭(FWHM, full width at half magnitude)이 큼

○ 예 : UV cut-off filter, NIR 흡수 필터

종류 1. 홑살 분광광도계(single-beam spectrophotometer)

○ 다색광 → 단색화 장치(monochromator) → 단색광

○ 투과율 P/P0을 측정

○ 시료와 용매를 번갈아 측정 : 광원의 세기 및 검출기의 감도가 변함에 따라 오차가 발생함

종류 2. 겹살 분광광도계(double-beam spectrophotometer)

○ 빛이 시료와 레퍼런스 용기를 번갈아 가며 통과함

○ 시간에 따른 광원의 세기 및 검출기의 감도 변화에 따른 오차를 최소화할 수 있음

 

입력: 2019.05.02 09:32

수정: 2020.03.04 15:29